Il n'existe pas de règle universelle pour créer un site internet. Selon la thématique abordée, le type d'informations diffusées, chaque site aura sa propre organisation, sa propre structure. Néanmoins, cette organisation est à prendre en considération dès le début de la conception du site car c'est un élément important pour un meilleur référencement. Si le visiteur a besoin d'une certaine logique pour s'y retrouver, il en va de même pour les moteurs de recherche.
Quelque soit l'information que vous passez, essayez de la décomposer en différentes rubriques puis sous-rubriques, si possible.
De cette façon, vos pages web seront plus précises et cibleront davantage le sujet abordé. Elles seront également plus nombreuses, et constitueront autant de portes d'entrée pour les visiteurs.
Au fur et à mesure que votre site s'organise, il faut également organiser le menu et la façon d'accéder aux différentes pages: la navigation.
Ce qui est important aux yeux des moteurs, c'est de pouvoir accéder à une page avec le moins de clics possible. On parle alors de niveau de profondeur pour atteindre une page. Si l'on considère la page d'entrée du site comme le niveau 0, un clic sur celle-ci nous amènera à une page A de niveau 1. Si un nouveau clic sur cette page A nous amène à une page B, cette dernière sera de niveau 2, et ainsi de suite comme le montre le shéma ci-dessous.


Il n'est pas inutile de construire une page avec un plan du site reprenant l'ensemble des pages et l'organisation de celles-ci avec bien entendu un lien vers celles-ci. Ainsi, toutes les pages du site se retrouvent avec un même niveau de profondeur.
Google propose d'ailleurs dans ses Outils pour webmaster, la possibilité de lui fournir un Sitemap (plan du site) au format xml afin qu'il indexe toute les pages d'un site.